Xanh methylene là một chất ức chế monoamin oxidase (MAOI),[26] và nếu tiêm tĩnh mạch với liều dưới 5 mg / kg, có thể kết tủa serotonin độc tính nghiêm trọng, hội chứng serotonin, nếu kết hợp với các thuốc ức chế tái hấp thu serotonin chọn lọc (SSRIs) hoặc các chất ức chế tái thu gom serotonin khác, duloxetine, sibutramine, venlafaxine, clomipramine, imipramine). 

Nó gây thiếu máu tán huyết ở người mang bệnh thiếu hụt enzyme G6PD (favism).